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每个人体内都居住着100万亿个细菌细胞，是人体本身细胞数量的10倍。科学家之间已有一个普遍共识，那就是细菌并非是随机的定居在人体某处，它们也能组成社区，与人类共同演化，也能一代一代传承下去。微生物学家Margaret McFall-Ngai说，"人体并非是真正的个体，他们是生物体的社区。这一视角或是以全新方式看待疾病的根据。" 例如，最近有证据显示，肥胖可能与微生物的组成相关。华盛顿大学医学院Jeffrey Gordon实验室发现瘦和胖的双胞胎有着截然不同的细菌社区，这些微生物不仅帮助对食物的直接处理，还决定着能量是否最终以脂肪形式储存在人体内。去年，美国国家卫生研究院发布了人类微生物组项目，确定人体微生物环境性质及确定它在健康与疾病中所起作用。威斯康星大学麦迪逊分校生理学家和生态学家 William Karasov认为新方法的重要性将是深远的。"我们皆被告知自己是人类"，细菌则通常被认为是一个传染源，或者是人体内居住的良性微生物，但事实上，我们可能与微生物是紧密相连的，人体还存在一个我们没有想过的微生物组成。
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